获得大分子（蛋白质、DNA、RNA）是几乎每个生物学实验室的日常事物，对于这样的日常工作，每个实验室各有一套运作的方法和体制。

我去的实验室主要从事蛋白质的结构生物学研究，需要制备大量的蛋白质。为了节约时间和成本，实验室有专人负责基因克隆、工程细菌/真菌/细胞转染的工作。这一套工作几乎完全程式化了，有标准的操作指南、商品化的试剂，但仍然有一些窍门，初学者需要跟着一个好师傅才能融会贯通，才能在出现异常结果或者不能到达预期目标时想出解决的办法。通常这一阶段的工作比较轻松，大部分工作由PCR仪、工程细菌来完成，上班8小时，至少有5个小时可以干别的（工作），但是得到的工程菌或工程细胞可是实验室的秘密武器，轻易不给人！听说有的实验室甚至会在低温冰箱的附近藏匿一个摄像头。

在华盛顿大学的实验室，我的工作从一只涂布了工程菌的培养皿开始。我先得复制一批这种细菌，和培养液一起放在冻存管里，加入甘油混合好， -80℃冻存。 接下来要用大体积的容器来扩增细菌，诱导蛋白质在其中表达；收集细菌，用适当的方法破坏细菌，使蛋白质溶出；然后摸索出一条路径最短、效率最高的方法纯化目标蛋白。这是最辛苦的工作，有大量的体力劳动要做。为了保护蛋白质，纯化工作通常要在4度进行。有的实验室用低温柜，人在柜外还好些，华大的老板有一间4℃的实验室，老要进去操作，一天下来能量消耗真的很大。另外，还要配大量的各种溶液。

然而，纯化蛋白不是目的，是另一个开端。研究结构生物学必须依靠现代生物物理的方法，X-线晶体衍射可以说其中功能最强大的。但是，使用这种仪器的前提条件是先要获得蛋白质晶体——晶体必须单一、纯净、完美——才有可能得到数据；数据还要经过数学方法还原，才能在物理空间构建蛋白质的三维结构。如果晶体够好，数据够清晰，就有可能计算出原子分辨率的蛋白结构，也就是说，原子之间的键长和键角最大限度地接近真实。如果晶体马马乎乎，数据将将就就，经过艰苦的计算，也能得到一个近似真实的空间结构，可以用来做生物学功能分析。如果晶体太差，就连数据也得不到了。而如果连晶体都没有，那么连仪器的边儿都碰不着。

在反复实验也长不出来晶体的时候，可能需要裁切蛋白质的序列，就要回到起点，重新做基因克隆……有时为了提高效率,在开始时就设计好几条不同长度的序列，同时做平行实验。如果再不成功,就得跟老板讨另外的蛋白来做, 一切的工作重新来过!

这样的生活也可以用那句著名的话来概括：痛并快乐着！

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