有了纯化的蛋白质，把溶液浓缩、过滤（除去大的聚集体）后，就可以开始长晶体了。中间关键的是浓缩过程要算计好，要浓缩到足够浓（否则不容易结晶），但有不能过分浓，太浓了蛋白质的分子之间容易互相聚集，也不能够结晶。我一般浓缩到10mg/ml时留出一部分样品，剩下的继续浓缩至最高浓度（比如长晶体的实验需要300ul样品，我就把溶液浓缩到只有320ul），一些溶解度好的蛋白质，能浓缩到高达60~120mg/ml；大多数样品能浓缩到20~30mg/ml。长晶体的实验（set up crystallization exp.）在北美的各个晶体学实验室被俗称为set up tray，因为晶体长在24孔板（悬滴法，hanging drop）或96孔板（坐滴法，sitting drop）上。

当一些人在实验室埋头苦干，期待挖到金矿时，另一些聪明人早把挖矿需要的一切做成了商品，积累了真金白银。实验室如果自己配结晶试剂，都选择原料纯度等级最好的Sigma－Aldrich公司或 Fluka公司的产品，如果试剂不纯的话，很难重复得到晶体；实验室基本都用买来的配好的试剂，这样至少可以保证

标签:

点击: 866 | 阅读全文...

（一）钾：矿物质中名列榜首的“护心”元素

　　它可以抑制心肌的兴奋性，控制心率；还可排出体内多余的钠，稳定血压，减轻心脏负担。

　　哪些食物富含钾？

　　苋菜、菠菜、甘薯、土豆、荸荠、慈菇、香菇、冬菇、蘑菇、豌豆、蚕豆和毛豆等蔬菜；香蕉、鲜枣、柑橘及橄榄等水果，都是钾的“富矿”。

　　建议摄取量：专家建议，每人每天应摄入钾2300毫克左右（相当于一天吃5根香蕉）。

标签:

点击: 656 | 阅读全文...

蛋白质的纯化工作开始于工程菌的大量制备。通常培养大肠杆菌用LB培养基，根据要表达蛋白质的特殊要求加入一些特殊的营养物质；一定要加抗生素以避免细菌污染（工程菌具有选择性的抗生素耐药性）。制备用于多（单）波长反常散射（MAD/SAD）X线晶体衍射实验的蛋白质，需要使用特殊培养基（M9），只含有9种生命体生长必须的盐，加入葡萄糖、11种氨基酸+硒取代硫的甲硫氨酸、甘油（提供碳元素），这样获得的蛋白质分子中所有的甲硫氨酸上的硫元素被硒元素取代，其晶体在X线照射下产生的衍射点中有重金属硒的信息，很容易鉴别和定位；硒的信息就像参照系一样，通过比较计算出分子中C、N、O等原子的空间位置信息。H原子的位置通常不可能被计算，除非晶体好到衍射点的分辨率接近原子分辨率（1.1Ǻ）。

那些发明实验方法的人很值得敬佩，即使是一个小小的培养液配方，也会让科学界的面貌大为改观。而在每一个实验室，精通蛋白质纯化的实验员通常为老板所重用，别人要依赖他们提供的样品。这样的人会成为老板“铁打的营盘”中的极少数成员。但是在决大多数实验室，还是“流水的兵”比较多，博士、博士后们八仙过海，各显神通。

在Argonne国家实验室，工作氛围较为轻松，这可能和他们多半的职责是提供服务，完成国家项目有关（自己找钱的压力比较小），其中不乏心灵手巧的聪明人。用2L的可乐瓶来培养细菌就是他们发明的，不仅节约了设备空间（4L的三角瓶很占地方），也节省了劳动力——一次性的塑料用品，使用前不需要高压灭菌，使用后可以用乙醇简单处理就扔掉！

标签:

点击: 685 | 阅读全文...

获得大分子（蛋白质、DNA、RNA）是几乎每个生物学实验室的日常事物，对于这样的日常工作，每个实验室各有一套运作的方法和体制。

我去的实验室主要从事蛋白质的结构生物学研究，需要制备大量的蛋白质。为了节约时间和成本，实验室有专人负责基因克隆、工程细菌/真菌/细胞转染的工作。这一套工作几乎完全程式化了，有标准的操作指南、商品化的试剂，但仍然有一些窍门，初学者需要跟着一个好师傅才能融会贯通，才能在出现异常结果或者不能到达预期目标时想出解决的办法。通常这一阶段的工作比较轻松，大部分工作由PCR仪、工程细菌来完成，上班8小时，至少有5个小时可以干别的（工作），但是得到的工程菌或工程细胞可是实验室的秘密武器，轻易不给人！听说有的实验室甚至会在低温冰箱的附近藏匿一个摄像头。

在华盛顿大学的实验室，我的工作从一只涂布了工程菌的培养皿开始。我先得复制一批这种细菌，和培养液一起放在冻存管里，加入甘油混合好， -80℃冻存。 接下来要用大体积的容器来扩增细菌，诱导蛋白质在其中表达；收集细菌，用适当的方法破坏细菌，使蛋白质溶出；然后摸索出一条路径最短、效率最高的方法纯化目标蛋白。这是最辛苦的工作，有大量的体力劳动要做。为了保护蛋白质，纯化工作通常要在4度进行。有的实验室用低温柜，人在柜外还好些，华大的老板有一间4℃的实验室，老要进去操作，一天下来能量消耗真的很大。另外，还要配大量的各种溶液。

然而，纯化蛋白不是目的，是另一个开端。研究结构生物学必须依靠现代生物物理的方法，X-线晶体衍射可以说其中功能最强大的。但是，使用这种仪器的前提条件是先要获得蛋白质晶体——晶体必须单一、纯净、完美——才有可能得到数据；数据还要经过数学方法还原，才能在物理空间构建蛋白质的三维结构。如果晶体够好，数据够清晰，就有可能计算出原子分辨率的蛋白结构，也就是说，原子之间的键长和键角最大限度地接近真实。如果晶体马马乎乎，数据将将就就，经过艰苦的计算，也能得到一个近似真实的空间结构，可以用来做生物学功能分析。如果晶体太差，就连数据也得不到了。而如果连晶体都没有，那么连仪器的边儿都碰不着。

在反复实验也长不出来晶体的时候，可能需要裁切蛋白质的序列，就要回到起点，重新做基因克隆……有时为了提高效率,在开始时就设计好几条不同长度的序列，同时做平行实验。如果再不成功,就得跟老板讨另外的蛋白来做, 一切的工作重新来过!

这样的生活也可以用那句著名的话来概括：痛并快乐着！

标签:

评论 1 | 点击: 746 | 阅读全文...

自制不同五花茶防治各种疾病 　

标签:

评论 1 | 点击: 1061 | 阅读全文...

今天是2002年2月1号，星期五。到美国的第11天。已经体验了太多的事情。

因为没有方向感，在WUSH U走了许多冤枉路，刚去实验室的头两天，找不到正确的楼梯口, 找不到回酒店的路。

因为要注册，要填许多表。不知道办公室的位置，只有四处问，然后去了还找不到人，错过了系里秘书给我约好的时间，不能再去找秘书，只好自己想办法。打电话是留言。到这人的email地址，给她发信解释没有去的原因，再问她的办公室地点，问什么时候可以再去。很快回了email，但要我先和办公室电话预约。在这里，打电话成了一种负担，我要先想一想说什么，到时候还会听不清，只有再问，反复地确认。我就这样打了电话预约，打了电话去让房东给我修下水道，打了电话去电话局开通电话。

标签:

点击: 708 | 阅读全文...

今天Nathan帮我找来James（他负责维护系里三个实验室的计算机），他让我的笔记本可以上网，还给我设了email地址，下载了eudola，他似乎说outlook的安全性不好。他们都是很好的人。

上午和下午两次去国际办公室送材料都扑了个空，这个办公室的办事态度和大部分中国人类似，官僚，态度冷漠。

今天圣路易斯阳光明媚。下午3点多我回酒店的房间休息了。现在是午夜2点。时差还没有倒好，我总是会在半夜两三点钟醒来。

1/26/02

昨天李明夫妇带我去取房间钥匙，又去买了床和几乎全部的生活必需品，从上午10点到下午5点，跑了一天，中午请他们吃麦当劳。遇到他们真的是我的幸运！徐箐芳帮我把床架安好，去她家聊天，李明切好菜，去打球了，晚上在他家吃火锅。晚上10点过又劳驾徐箐芳送我回酒店。给家里打电话。

在困难的时候能得到别人的帮助是很大的欣慰。但我必须学会独立生存的本事，学会在孤独的时候克服困难，享受人生。

半夜两点又醒了，时差似乎不依我的意志逆转，那就既来之，则安之吧。我起床热一杯牛奶喝，想了想该做的事情。大概又迷糊了2个多小时，不到8点起来。给房东打电话，叫他们修厨房的水池，下水不好，厨房有难闻的味儿，因为是星期天，没有人接电话，只有留言，这是我第一次对着留言机说英语，感觉怪怪的。到studio去铺床，搬了一部分东西过去。再回酒店休息。困得几乎睡着了，可是想着不能总让时差捣乱，而且还得去买一个电话，就又起来了。

出去找商店。中午12点多的阳光暖暖的照着人，圣路易斯已经是早春的气象，路上少有人，行人一两个，还有一两个美国人在跑步。走了三个街区，问了一个黑人店员，我终于找到了卖电话的商店，花5元买了一个最便宜的！到这时，我心里轻轻舒了一口气，经过了这几天，我相信自己过了生存的第一关。

这是在美国的第一个星期天。

标签:

评论 1 | 点击: 664 | 阅读全文...

我信仰普救说（Unitarian Universalism），这是以上帝为核心，承认其他宗教如佛教、犹太教、印度教等的一种宗教。它的标志是两个圆环套着一掌油灯，寓意是照亮世界、驱散人们心中的黑暗。

多数时候我不可能向别人解释这种信仰，尤其在单位填表时，宗教信仰一项我填的是“无”。实际上我读圣经，和信仰基督教的朋友交流心得和感悟。有时和家人、朋友出游到了道家或佛家的寺庙，我也会虔诚地跪拜。家里人对我的这种行为不以为意——他们不知道我有多认真；亲近的朋友有时会嘲笑我，说“你的上帝会生气的”。

家里人只有我奶奶信佛教（她老人家已在92岁时过世了，我会梦到她），但我一直认为她是迷信佛教。她是农村人，二十几岁时开始念佛；没有上过学，但能读佛经（是那种梵语汉字化的版本），有时问家里人一些奇怪的字怎么念。我经常很怀疑：那些经书上的字对她而言有什么样的意义？而且她和我妈有芥蒂，主要原因是在医院的家属区常责备我妈只会生女儿（我妈经常当医院的优秀党员，自然受不了），到老了和公园里的老奶奶们聊家常时，居然说家里有三个孙孙（我爸是独生子），两个是孙女，最小的一个是孙子——这是有一次我回家她亲口跟我说的，当时让我很是生气了一会儿。——所以我想她的信仰只能是迷信，真正的信仰中人不应有偏见，不应对人不公。（远不如我爸爸这个已经离休的纯粹的唯物主义者，他经常自豪地跟人说：我有“三千金”。）——然而，这些都不防碍我爱我奶奶，这是源于血缘的爱，无原则、无条件。如同我可以严肃地批评大姐，温和地教导二姐；或者皱着眉头埋怨爸爸，苦口婆心地开导妈妈，但决不允许旁人说他们一个不字，我会轻则反唇相讥，重则拍案而起。

宗教于我就是宗教，与情感无关。在困境中，我信靠基督救赎人类的恩许，我相信上帝在我面前关上的那道门定不适合我，而在别处一定为我留有一扇窗！佛、儒是教我照顾身心健康的良方。不过，有的人可能不信教，实际已有一副菩萨心肠，心神合一，令人敬佩。

2．对人公平、公正、有同情心（Justice, equity and compassion in human relations）

标签:

点击: 757 | 阅读全文...

1/25/02

昨天见了老板一面，问他我能否看看组里别人的论文，他说了一堆话，我听不清，意思好象是没有。他说我可以到网上查文献，并给了我几篇他们发的文章，告诉我先跟李敏学蛋白表达和纯化，等两三周我熟悉了实验方法和实验室后再和他谈课题。老板是一个为别人考虑的比较周全的人，他今天就要到法国去，大约去两周，我可以用这段时间好好准备。

老板给我安排了一张办公桌。实验室的计算机很多，几乎人手一台。但我自己的笔记本不知怎么设置，还不能上网。

中午在楼下的快餐店吃饭，在里面转了又转，不知怎么买（买什么？他们是把许多东西配在一起卖，我不知道怎么配）。看见有人拿盘子自己取蔬菜等，然后排队交钱，我也取了一些蔬菜，都是生的，交钱时是按重量付。喝饮料（可乐，咖啡，碳酸饮料）不花钱。

李明告诉我中午和房东约好看房子，这房子就在李明家楼下，一楼。一间房，另有比较大的卫生间和厨房（冰箱，煤气灶，烤箱，碗柜），没有家具，加起来大约30多平米。当时就定下要租，需要预付450的押金，每月初交360。看完房子李明的妻子徐箐芳开车带我买东西，去了圣路易斯的中国城和一些附近的美国商店。所谓的中国城其实就是两三家连在一起的中国人开的杂货店，在那里买到电话卡和牛奶，面包，西红柿。徐箐芳也是一个很热心的人，她五月份要生孩子了，所以很快要搬家。她陪李明来的，没有工作，在家闲呆着，她说在美国最大的娱乐就是购物。晚饭在他们家吃的，米饭真香，这是我几天来第一次正经吃饭。真的很感谢他们的帮助，这是一对善良的夫妻，他们说刚来都挺难的，他们那时也得到了别人的帮助。晚上他们又开车带我去实验室拿了信封，把租房合同和押金的支票装好，又送到房东家，从他家门缝塞进去。然后他们再把我送到住的地方。今天真象是在中国过的。

到这来的每个人都有自己的美国梦。美国是一个很干净，很文明的地方，这里的一切都在井井有条地进行，这些都让人欣赏。

标签:

点击: 708 | 阅读全文...

在底特律机场转机时，要办很多手续，先是排很长的队，等待移民局查身份，给签证盖戳。然后要取行李，我没有看见机场有帮忙的人，自己把行李拽上推车，这时听见有人推着他们特制的推车，问need any help？我听不清，反应了十几秒才明白这句话的意思，所以没理他就过去了， 把行李放到转机的传送带上，已经筋疲力尽了。到海关检查随身物品，要脱了鞋检查，折腾了一身汗。底特律机场很大，要坐机场巴士到各个转机口，熙熙攘攘的中国人四处分散了。因为离起飞时间远，我要坐的航班没有显示在牌上，坐了两次机场巴士才打听到确切的侯机处，到了地方才松了一口气。在这里中国人已经很少很少了，美国人也在赶路，他们要么打电话，要么安静地坐着，互不打扰。机场算是一个社会的缩影，我感觉到的区别只是他们和我们说不同的语言，有不同的肤色，他们的环境条件比我们好。他们也各有各的生活，所以，那种不能融入美国社会的说法也偏了，我们都是中国人，生活在中国，又有谁能融入谁的生活？大家不也各过各的吗？

在机场的自动售卡机上买了一张电话卡，给老板打了一个电话，告诉他我到了底特律，听起来他很高兴。

到圣路易斯，老板和一个叫李敏的中国女孩来接，费了好大劲才把行李都装进老板的车。老板是法国人，人很好。我被安排在一家叫Best Western的酒店暂住，这时已经是下午五点过了。七点时不得不出门找东西吃，还想买电话卡，找了半天都是一些快餐店，也不知道该买什么，最后买了一种叫steak的，是肉，蔬菜，米饭，调味酱，用一张饼裹起来。已经8点过，不敢再去找电话卡。真的，在生存遇到问题时，首先满足的是物质需求，精神只能放在其次了。这是第一天。

第二天老板来接我到实验室，他有一个大研究组，十几个人，仪器主要是x-线衍射和层析系统，还有几台工作站，实验室还有一个叫李明的中国人，也是博士后。听了组里一个人做报告，老板简单问了我做过的工作，他说我需要从头学起。然后我坐校车从medical school到 hilltop school的国际办公室问租房子的事，他们只给了我一个电话号码，只好又回来，遇见老板，他带我去图书馆。中午，到系秘书的办公室填表，需要申请social security number，办 employee orientation等注册手续。然后老板叫实验室一个叫Nathan的美国人带我去银行开帐号，这是一个很好的人，他带我去买了电话卡，给他女儿买了一个好看的冰箱贴（哎呀，这时我才想起来我应该一起替他付了才对！）。回去老板见我没事，叫我去听报告，作报告的人是Steven Chu实验室的一个中国人，英文很好，讲single molecular fluorescence研究大分子结合，蛋白折叠和动力学过程。听完报告我跟老板说如果没有事的话我就先回去了。我想自己找到路，结果是找了一个小时才找到（本来10分钟的路），已经6点了。买了一个汉堡，味道很好。

华盛顿大学很大，很美，但我没有游兴。我坐在房间里写下这些。也没法上网。

1/23/02

标签: 书山有路 学海无涯

评论 1 | 点击: 906 | 阅读全文...

这样的橱窗给冷得伸不出手的冬天，平添了许多暖意。──谁看了不心动、不去买上一本书，享受躲在家里既享清闲又长见识的生活情调？

标签: 行在美国

评论 2 | 点击: 793 | 阅读全文...